Izračun računske kvantne mehanike: 4 koraki

2024 Avtor: John Day | [email protected]. Nazadnje spremenjeno: 2024-01-30 12:04

Računalniški izračuni v kemiji in fiziki lahko odkrijejo zelo zanimive lastnosti na nekaterih vzorcih (še posebej, če jih je treba spremeniti zaradi boljše učinkovitosti dane prvotne spojine). v postopkih poleg faktorjev dipolnega momenta, nestabilnosti, zemljevida elektrostatičnega potenciala, energetskega diagrama in izračunov propabilistične reaktivnosti, kjer uporaba računskih kvantnih izračunov skrajša laboratorijski čas, s čimer je jasno in specifično, če je sinteza možne spojine izvedljiva. ekonomsko in časovno rečeno.

Zaloge

• Kvantna
• Modeliranje molekul.
• Molekularne orbitale Orca Avogadro

1. korak: Izračun računske kvantne mehanike - Avogadro

Najprej prenesite Avogadro, ki ima možnost vnosa s programsko opremo Orca

V programski opremi Avogadro boste zagotovo ustvarili svoje molekule in jih optimizirali za 99,9%; da bi se izognili konfliktom z ukazom Ctrl + Alt + o, kar pa ne zagotavlja ustrezne molekularne kompresije pri uporabi vhodnih razširitev za Orca.

Za optimizacijo molekule najprej ustvarite zanimivo molekulo (očitno), nato kliknite E (upoštevajte, da je pod tem E puščica navzdol), zato se bo podoben izračun pojavil v zgornjem levem kotu zaslona, ki vsebuje programsko opremo.

2. korak: programska oprema Orca

Ko je ta vnos pravilno izveden, kliknite zavihek razširitev, ki se še vedno nanaša na programsko opremo Avogadro, in poiščite možnost ORCA

Kliknite na Napredno, ko se odpre zaslon za ustvarjanje vnosa, na Datum pa označite možnost MO in drugo spodaj. - PUSTITE DVE ZNAKE - da dobite elektronsko gostoto in aktivirane molekularne orbitale med kvantnimi izračuni, ki jih bo izvajala Orca - samo vnosni postopki;)

Po takem postopku na zavihku Osnovno dokončajte po ukazu:! RHF SP def2-SVP

pravilno / previdno vnesite kodo …

! Običajen tisk

% izhod

Natisni [P_Basis] 2

Natisni [P_MOs] 1

konec

Podrobnosti, preden izvedete takšno operacijo, prenesite in namestite Orco v računalnik!

Po izvedbi zgornjih ukazov kliknite Ustvari in shranite takšno datoteko. Vnesite v mapo, kjer je nameščen Orca. (Primer: namestil sem Orco na pogon C v računalniku -> shrani datoteko v pogon C računalnika v mapo Orca).

3. korak: V Cmd Run…

Odprite cmd in vnesite:

cd C: / Orca; Programska oprema Orca je nameščena na pogonu C vašega računalnika … in pritisnite enter.

Dobili boste zaslon, podoben sliki tega dela, po takem postopku opazite, ali je ukaz pravilen po skriptu C: / Orca> Če je ta ukaz pravilen, vnesite pred znak plus (>) ukaz:

orca.exe (ime molekule, ki ste jo shranili v mapo Orca).inp> (ime molekule, ki ste jo shranili v mapo Orca).out

PODROBNOST - V UKAZU NI SODNIKOV IN SAMO IME VAŠE MOLEKULE

Po tem pritisnite enter in počakajte … V mojem primeru sem ukaz večkrat zgrešil, ker je vključena množica liha vrednost in je tudi moje število elektronov liho, če se to zgodi, spremenite vrednost množice na 2 v prejšnjem koraku v Osnovnem (v Programska oprema Avogadro).

4. korak: Počakajte minuto…

Po podanem ukazu poiščite podčrtaj v naslednji ukazni vrstici cmd

če obstaja, WONDER, se nadaljuje … Počakajte nekaj časa, da se pojavi izraz skripta:

cd: / Orca_

Da bi zagotovili, da je bila vaša datoteka.out ustvarjena v namestitveni mapi Orca, v kateri je bila shranjena vhodna datoteka, ustvarjena v Avogadru.

Ko je izračun opravljen prek cmd v Orci, poiščite datoteko.out v mapi Orca. V tem trenutku lahko zaprete svojo molekulo (Avogadro) in cmd, na koncu je kvantni izračun že opravljen …

V naslednjem koraku znova odprite Avogadro in na odprtem zavihku poiščite ustvarjeno datoteko.out in jo odprite; videli boste, da bo poleg orbitalnih vrednosti HOMO in LUMO še vaša molekula, povlecite zavihek nekoliko navzdol in videli boste, da obstajajo izračuni za orbitale, ki bodo dale približno 100% optimizacijo, kot razkriva slika.

… in se zabavaj …